Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD44P16070 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD44P16070 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD44P16070 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD44P16070 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD44P16070 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD44P16070 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD44P16070 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD44P16070 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD44P16070 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD44P16070 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD44P16070 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD44P16070 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD44P16070 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD44P16070 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD44P16070 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms