Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA1P15085 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA1P15085 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA1P15085 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA1P15085 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA1P15085 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA1P15085 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA1P15085 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA1P15085 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA1P15085 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA1P15085 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA1P15085 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA1P15085 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA1P15085 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA1P15085 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA1P15085 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA1P15085 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA1P15085 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA1P15085 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA1P15085 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA1P15085 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA1P15085 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA1P15085 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA1P15085 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA1P15085 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA1P15085 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA1P15085 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA1P15085 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA1P15085 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA1P15085 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA1P15085 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA1P15085 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA1P15085 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA1P15085 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA1P15085 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA1P15085 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA1P15085 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA1P15085 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA1P15085 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA1P15085 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA1P15085 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA1P15085 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA1P15085 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA1P15085 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA1P15085 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA1P15085 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA1P15085 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms