Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB3P14651 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB3P14651 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB3P14651 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB3P14651 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB3P14651 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB3P14651 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB3P14651 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB3P14651 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB3P14651 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB3P14651 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB3P14651 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB3P14651 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB3P14651 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB3P14651 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB3P14651 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB3P14651 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB3P14651 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms