Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT10P13645 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT10P13645 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT10P13645 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT10P13645 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT10P13645 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT10P13645 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT10P13645 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT10P13645 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT10P13645 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT10P13645 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT10P13645 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT10P13645 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT10P13645 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT10P13645 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT10P13645 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT10P13645 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT10P13645 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT10P13645 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT10P13645 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT10P13645 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT10P13645 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms