Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIP12755 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIP12755 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIP12755 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIP12755 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIP12755 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIP12755 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIP12755 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKIP12755 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKIP12755 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIP12755 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIP12755 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIP12755 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIP12755 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIP12755 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIP12755 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKIP12755 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKIP12755 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SKIP12755 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIP12755 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIP12755 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIP12755 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIP12755 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIP12755 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIP12755 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIP12755 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIP12755 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms