Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL6A2P12110 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms