Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CETPP11597 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CETPP11597 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CETPP11597 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CETPP11597 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CETPP11597 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CETPP11597 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CETPP11597 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CETPP11597 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CETPP11597 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CETPP11597 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CETPP11597 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CETPP11597 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CETPP11597 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CETPP11597 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CETPP11597 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CETPP11597 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CETPP11597 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CETPP11597 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CETPP11597 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CETPP11597 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CETPP11597 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CETPP11597 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CETPP11597 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CETPP11597 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CETPP11597 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CETPP11597 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CETPP11597 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CETPP11597 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CETPP11597 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CETPP11597 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CETPP11597 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CETPP11597 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms