Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDRP11473 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDRP11473 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDRP11473 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDRP11473 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDRP11473 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDRP11473 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDRP11473 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDRP11473 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDRP11473 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VDRP11473 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VDRP11473 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VDRP11473 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VDRP11473 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDRP11473 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDRP11473 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDRP11473 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDRP11473 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDRP11473 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDRP11473 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDRP11473 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDRP11473 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDRP11473 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VDRP11473 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDRP11473 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDRP11473 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDRP11473 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDRP11473 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDRP11473 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDRP11473 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDRP11473 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDRP11473 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDRP11473 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDRP11473 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDRP11473 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms