Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TOP2AP11388 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TOP2AP11388 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2AP11388 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms