Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP3P10745 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP3P10745 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP3P10745 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP3P10745 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP3P10745 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP3P10745 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP3P10745 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP3P10745 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP3P10745 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP3P10745 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP3P10745 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP3P10745 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP3P10745 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP3P10745 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP3P10745 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP3P10745 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP3P10745 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP3P10745 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP3P10745 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP3P10745 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP3P10745 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP3P10745 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP3P10745 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP3P10745 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms