Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C8orf88P0DMB2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf88P0DMB2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms