Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2P0DI81 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms