Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBBP0CG47 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms