Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms