Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR29P0C7W0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR29P0C7W0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms