Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CT47B1P0C2W7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CT47B1P0C2W7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms