Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C4AP0C0L4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4AP0C0L4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms