Protein–RNA interactions for Protein: P09661

SNRPA1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA1P09661 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNRPA1P09661 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNRPA1P09661 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPA1P09661 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPA1P09661 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms