Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSLP07711 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSLP07711 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSLP07711 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSLP07711 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSLP07711 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSLP07711 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSLP07711 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSLP07711 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSLP07711 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSLP07711 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSLP07711 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSLP07711 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSLP07711 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSLP07711 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSLP07711 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSLP07711 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSLP07711 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSLP07711 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSLP07711 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSLP07711 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSLP07711 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSLP07711 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSLP07711 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSLP07711 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSLP07711 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSLP07711 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSLP07711 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSLP07711 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSLP07711 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSLP07711 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSLP07711 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSLP07711 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSLP07711 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSLP07711 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSLP07711 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSLP07711 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSLP07711 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSLP07711 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSLP07711 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSLP07711 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms