Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAVP06756 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms