Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFAP2AP05549 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TFAP2AP05549 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms