Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPN1P04843 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPN1P04843 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPN1P04843 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPN1P04843 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPN1P04843 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPN1P04843 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPN1P04843 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPN1P04843 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN1P04843 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN1P04843 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN1P04843 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN1P04843 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN1P04843 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN1P04843 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN1P04843 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN1P04843 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPN1P04843 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPN1P04843 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPN1P04843 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPN1P04843 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPN1P04843 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPN1P04843 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPN1P04843 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPN1P04843 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPN1P04843 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPN1P04843 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPN1P04843 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms