Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOA1P02647 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOA1P02647 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOA1P02647 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOA1P02647 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOA1P02647 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOA1P02647 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOA1P02647 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOA1P02647 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOA1P02647 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOA1P02647 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOA1P02647 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOA1P02647 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOA1P02647 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOA1P02647 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOA1P02647 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms