Protein–RNA interactions for Protein: P01834

IGKC, Immunoglobulin kappa constant, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKCP01834 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKCP01834 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKCP01834 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKCP01834 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGKCP01834 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKCP01834 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKCP01834 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKCP01834 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKCP01834 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKCP01834 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKCP01834 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKCP01834 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKCP01834 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms