Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASS1P00966 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASS1P00966 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASS1P00966 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASS1P00966 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASS1P00966 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASS1P00966 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ASS1P00966 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASS1P00966 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASS1P00966 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASS1P00966 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASS1P00966 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASS1P00966 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASS1P00966 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ASS1P00966 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASS1P00966 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASS1P00966 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASS1P00966 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASS1P00966 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASS1P00966 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASS1P00966 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASS1P00966 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASS1P00966 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASS1P00966 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASS1P00966 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASS1P00966 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASS1P00966 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASS1P00966 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASS1P00966 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASS1P00966 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASS1P00966 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASS1P00966 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASS1P00966 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASS1P00966 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASS1P00966 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms