Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HPRP00739 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HPRP00739 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPRP00739 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HPRP00739 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HPRP00739 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HPRP00739 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPRP00739 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPRP00739 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPRP00739 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPRP00739 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPRP00739 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPRP00739 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPRP00739 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPRP00739 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPRP00739 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPRP00739 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPRP00739 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPRP00739 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPRP00739 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPRP00739 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HPRP00739 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPRP00739 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPRP00739 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPRP00739 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPRP00739 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPRP00739 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPRP00739 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms