Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSL3O95573 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms