Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC24BO95487 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24BO95487 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms