Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC24AO95486 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24AO95486 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms