Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLDN7O95471 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms