Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms