Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB5O95377 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB5O95377 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB5O95377 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB5O95377 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB5O95377 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB5O95377 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB5O95377 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB5O95377 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB5O95377 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB5O95377 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB5O95377 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB5O95377 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB5O95377 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB5O95377 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB5O95377 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB5O95377 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB5O95377 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB5O95377 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB5O95377 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB5O95377 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB5O95377 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB5O95377 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB5O95377 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB5O95377 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB5O95377 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB5O95377 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB5O95377 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB5O95377 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB5O95377 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB5O95377 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB5O95377 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB5O95377 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB5O95377 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB5O95377 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB5O95377 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB5O95377 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB5O95377 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB5O95377 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB5O95377 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB5O95377 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB5O95377 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB5O95377 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB5O95377 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB5O95377 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB5O95377 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB5O95377 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms