Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CCNDBP1O95273 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CCNDBP1O95273 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CCNDBP1O95273 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CCNDBP1O95273 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CCNDBP1O95273 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CCNDBP1O95273 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CCNDBP1O95273 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNDBP1O95273 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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