Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOBTB3O94955 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms