Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFPL2O75678 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL2O75678 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms