Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPS6KA4O75676 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KA4O75676 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms