Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN11O75508 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms