Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms