Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR5O60602 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR5O60602 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR5O60602 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR5O60602 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR5O60602 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR5O60602 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR5O60602 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR5O60602 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR5O60602 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR5O60602 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR5O60602 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR5O60602 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR5O60602 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR5O60602 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR5O60602 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR5O60602 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR5O60602 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR5O60602 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR5O60602 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR5O60602 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR5O60602 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR5O60602 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR5O60602 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR5O60602 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR5O60602 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR5O60602 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR5O60602 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR5O60602 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR5O60602 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR5O60602 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR5O60602 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR5O60602 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR5O60602 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR5O60602 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR5O60602 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR5O60602 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR5O60602 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR5O60602 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR5O60602 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR5O60602 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR5O60602 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR5O60602 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR5O60602 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR5O60602 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TLR5O60602 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms