Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR2O43760 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms