Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms