Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATCO43716 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GATCO43716 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GATCO43716 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATCO43716 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATCO43716 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATCO43716 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATCO43716 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms