Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNQ2O43526 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ2O43526 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms