Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51CO43502 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms