Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRTM2O43300 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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