Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 CAMK2D-203ENST00000379773 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 CAMK2D-208ENST00000508738 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 CAMK2D-214ENST00000515496 1533 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 CAMK2D-213ENST00000514328 1497 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 FGFR1-219ENST00000475621 485 ntTSL 28.25□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.46e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-211ENST00000505649 1509 ntTSL 54.95□□□□□ -1.626e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.666e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-205ENST00000476441 1604 ntTSL 54.66□□□□□ -1.666e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.666e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-216ENST00000511370 1519 ntTSL 54.57□□□□□ -1.686e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.756e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.756e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.766e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.776e-14■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 215.57■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SH3BP2-209ENST00000504450 844 ntTSL 58.9□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 MFN1-202ENST00000357390 3148 ntTSL 25.5□□□□□ -1.532e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-204ENST00000525039 1780 ntTSL 1 (best)13.99□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-213ENST00000532085 5862 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-206ENST00000525372 1388 ntTSL 1 (best)13.84□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-211ENST00000529510 850 ntTSL 513.08□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-212ENST00000530407 1472 ntTSL 213□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-219ENST00000638360 1912 ntTSL 511.89□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-215ENST00000534384 554 ntTSL 411.57□□□□□ -0.567e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-205ENST00000525102 2844 ntTSL 211.45□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-220ENST00000638925 2046 ntTSL 511.16□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-210ENST00000527992 2040 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-218ENST00000638186 2074 ntTSL 510.74□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-208ENST00000526275 2626 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.767e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-209ENST00000526626 730 ntTSL 59.95□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-203ENST00000524428 1526 ntTSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-207ENST00000525787 1058 ntTSL 27.84□□□□□ -1.157e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 SLC37A4-214ENST00000532888 1351 ntTSL 57.8□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 28.3
RBFOX2O43251 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.052e-17■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 AL109930.1-201ENST00000606932 724 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-17■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 NFX1-202ENST00000379521 3609 ntTSL 1 (best)5.71□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 SPG7-218ENST00000568205 463 ntTSL 212.55□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 212.15□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 FBRS-206ENST00000494101 2782 ntTSL 211.66□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 FBRS-209ENST00000570170 1316 ntTSL 510.84□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.893e-15■■■■■ 28.2
RBFOX2O43251 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 GTF2IRD1-204ENST00000470715 824 ntTSL 38.13□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 GIT2-210ENST00000548000 595 ntTSL 48.14□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 NPIPA1-203ENST00000472413 5345 ntTSL 213.34□□□□□ -0.273e-23■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)18.95■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)18.95■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)15.72■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 514.2□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 410.41□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 49.47□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 55.04□□□□□ -1.63e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.448e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 SOX5-201ENST00000367206 1816 ntTSL 25.46□□□□□ -1.538e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 CARM1-209ENST00000590699 2240 ntTSL 522.92■■□□□ 1.267e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.897e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.457e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 CARM1-203ENST00000586221 2766 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 CARM1-205ENST00000586508 1050 ntTSL 212.78□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 CARM1-204ENST00000586298 674 ntTSL 512.16□□□□□ -0.467e-7■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 511.31□□□□□ -0.67e-9■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 TMEM91-207ENST00000535712 400 ntTSL 210.86□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 TMEM91-212ENST00000546050 378 ntTSL 310.86□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 TMEM91-201ENST00000342187 454 ntTSL 58.11□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 TMEM91-213ENST00000546362 489 ntTSL 37.61□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 28.1
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