Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBDO15205 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBDO15205 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBDO15205 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBDO15205 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBDO15205 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBDO15205 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBDO15205 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBDO15205 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBDO15205 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms