Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB6O15197 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms