Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A3R1O14745 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3R1O14745 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R1O14745 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms