Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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